تطبيق طرق النمذجة الجزيئية في تصميم مثبطات محتملة لأنزيم HIV-1 Protease

الملخص

يعد مرض عوز المناعة المكتسب (AIDS) الذي يسببه فيروس عوز المناعة البشري (HIV) من أكثر الأمراض انتشاراً وخطورة في العالم، حيث يقدر حدوث نحو 85 مليون إصابة و40 مليون وفاة عالمياً منذ اكتشافه عام1981م. تمثل الإصابات بالنمط (HIV-1) حوالي 90% من إجمالي الإصابات حول العالم. تم بذل جهود مكثفة لمكافحة هذا الوباء الخطير، وعلى رأسها الأدوية المضادة للفيروسات القهقرية (ART) مثل مثبطات أنزيمات البروتياز، ولكن تواجه هذه الأدوية العديد من العقبات أهمها المقاومة الدوائية التي تبديها الفيروسات الطافرة، التوافر الحيوي المنخفض، والتأثيرات الجانبية السامة. تهدف هذه الدراسة إلى تصميم مثبطات HIV-1 Protease تتخطى هذه العقبات بتطبيق استراتيجيات مختلفة للنمذجة الجزيئية. تم أولاً مسح قاعدة بيانات Pubchem لتحديد مركب lead بواسطة معاملات Tanimoto للتشابه الكيميائي، ومن ثم فلترة المركبات عبر عدة مراحل من دراسات الحرائك الدوائية والإرساء الجزيئي من أجل تحديد مركب Lead. أخيراً تم تطوير مركب lead الناتج عبر تغيير المتبادلات من أجل الحصول على المثبطات النهائية.